截至目前，华大海洋共发表120余篇学术论文，其中SCI论文近100篇，代表性论文包括1篇Nature封面文章、6篇Nature子刊、12篇GigaScience文章；在国际已发表的70余种重要鱼类基因组文章种，华大海洋占据发表总量的1/5以上，支撑着我国水产基因组学的国际领先地位。华大海洋研究院出版的11部水产基因组学系列专著，填补了我国相关领域的教材空白，为水产基因科技的快速发展和普及做出了突出贡献。