不依赖参考基因对海洋动物进行全基因组测序及拼接组装，绘制出该物种的全基因组序列图谱。基因组测序可以获得该物种的全基因组序列，同时为后续鉴定物种特性，海洋特殊环境适应性及特殊生物生理学特点研究奠定了基础。

基因组序列是研究物种分子生物学的基础，通过全基因组De novo测序并进行全基因组组装，可得到物种全基因组序列图谱。随后在全基因组进行重复序列，基因结构和基因功能的预测。            

全基因组测序完成后不仅可进行常规标准分析，还可针对所研究物种的个性化生物学问题进行分析，针对某一类或特定一个物种的自身特点，结合转录组、重测序信息展开深入分析。并通过比较基因组学分析可对物种进行基因家族，系统进化，全基因组共线性和生物学特性分析。

海马的腹鳍在进化过程中逐渐退化和消失。通过海马、三棘鱼、斑马鱼全基因组共线性比较，我们发现tbx4基因(调节骨头形成的关键调控因子)在海马中特异性丢失。并且我们在斑马鱼中对tbx4基因进行基因敲除，最后得到的纯系敲除斑马鱼突变体确实缺少腹鳍。因此我们验证海马腹鳍的消失是由于tbx4基因的缺失而导致。